每年,欧洲因耐药病原体而导致的疾病超过67万例,感染致死人数达到3.3万。尤其令人担忧的是那些对多种甚至所有已知抗生素产生耐药性的病原体,其中之一便是鲍曼不动杆菌,现今被称为“医院超级细菌”。
据估计,约5%的医院获得性感染和十分之一的细菌感染死亡案例与这种病原体有关。根据世界卫生组织(WHO)的说法,这使得鲍曼不动杆菌成为亟需开发新疗法的病原体。
了解鲍曼不动杆菌的致病特征是实现这一目标的关键之一。为此,法兰克福歌德大学的Ingo Ebersberger教授及LOEWE转化生物多样性基因组学中心的生物信息学家正在比较不同不动杆菌菌株的基因组及其编码的蛋白质。
关于哪些基因影响致病性的结论可以从危险菌株与无害菌株的差异中得出。
由于缺乏合适的方法,相关研究主要集中在某一菌株中基因的存在与否上。然而,这忽视了细菌通过修改现有基因获得新特性的可能性,以及通过改变编码的蛋白质来获得新特性。
因此,Ebersberger的团队开发了一种生物信息学方法,跟踪进化谱系中的蛋白质修饰,并首次与法兰克福歌德大学的微生物学家合作,将该方法应用于不动杆菌。这项研究已发表在《公共科学图书馆遗传学》杂志上。
在研究过程中,研究人员重点关注毛发状细胞附属物,即IVa型(T4A)菌毛,这种细胞附属物普遍存在于细菌中,并用于与环境的相互作用。它们不仅存在于无害细菌中,甚至被认为是某些病原体毒力的关键因素,表明T4A菌毛在进化过程中反复获得了与致病性相关的新特征。
研究小组发现,位于T4A菌毛尖端的蛋白质ComC对其功能至关重要,并在致病性不动杆菌菌株中表现出明显变化。不同的鲍曼不动杆菌菌株也展现出不同的这种蛋白质变体。这使得生物信息学家Ebersberger将T4A菌毛比作一个多功能的园艺工具,虽然把手始终相同,但附着物却是可互换的。
Ebersberger表示:“通过这种方式,可以在短时间内实现显著的功能变化。”他假设,不同细菌菌株的T4A菌毛与环境的相互作用也可能不同,这可能决定病原体在人体内的定居位置。
研究的目的是利用对病原体高度多样性的理解,改善鲍曼不动杆菌感染的治疗。Ebersberger解释道:“基于我们的结果,有可能开发针对特定病原体菌株的个性化治疗方案。”
然而,Ebersberger和他的同事们的研究也揭示了其他一些问题:以往关于鲍曼不动杆菌比较基因组学的研究可能仅揭示了冰山一角。Ebersberger表示:“我们的方法在寻找病原体特征的潜在成分方面取得了显著进展。”
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